1. ¿Qué datos se almacenan y dónde son almacenados?
    • Los datos de metagenómica del 16S no se conservan luego de que las unidades taxonómicas operacionales se han identificado. Adicionalmente, los datos de secuencias del 16S solo proporcionan información en torno al gen 16S de cada organismo, no del genoma completo. Los archivos de salida se almacenan (si se solicitan) para análisis futuros en un análisis metagenómico del 16S.
  2. ¿Cuál es el tiempo de respuesta?
    • Los datos para la metagenómica del 16S implican la extracción significativa del ADN, la secuenciación y el procesamiento intensivo de datos. El tiempo de respuesta típico es de 7-10 días hábiles.
  3. ¿En que se diferencia la metagenómica del 16S de la secuenciación completa del genoma?
    • La metagenómica del 16S es un análisis de secuenciación ‘específica’. Antes de agregar muestras a un MiSeq, el gen 16S de cada organismo es amplificado. Luego, se añaden los productos de amplificación al MiSeq. La secuenciación del genoma completo hace un análisis de todo el ADN en un aislado.
  4. ¿Qué tamaño de muestra debe enviarse?
    • Tenemos recomendaciones sobre productos y muestras ambientales. El tamaño de la muestra puede depender de la homogeneidad del tipo de muestra, la ubicación del producto (trabajo en proceso, materia prima, vida útil, etc.)
  5. ¿Cómo comienza una empresa con la metagenómica del 16S?
    • Una rápida conferencia telefónica con un representante de Neogen ayudará a una empresa a entender los elementos clave para el diseño experimental. Posteriormente, una empresa puede descargar el formulario de envío de muestras y seguir las instrucciones de muestreo proporcionadas por Neogen. Después de enviar las muestras, se enviará un informe 7-10 días hábiles después de recibir las mismas.
  6. ¿Neogen ofrece recomendaciones e interpretaciones para los resultados metagenómicos?
    • Neogen puede ayudar a la mayoría de las empresas a interpretar los resultados metagenómicos del 16S. Hay científicos con doctorado disponibles para situaciones más complejas.
  7. ¿Las levaduras y mohos están cubiertos en la metagenómica del 16S?
    • No, las levaduras y mohos son eucariotas. Las levaduras y mohos no tienen el gen 16S, tienen un gen conservado diferente llamado 18s. Los productos genéticos del 16S hechos en este servicio no pueden ser utilizados para la identificación del 18s.
  8. ¿Las bacterias patógenas forman parte del perfil microbiano?
    • No, las especies de Listeria y Salmonella no se reportan en los informes metagenómicos del 16S de deterioro. Si un estudio específico requiere que estas bacterias sean identificadas, el servicio puede reportar estos organismos, si se solicita. E. coli es identificado, pero solamente al nivel de especie (es decir, E. coli genérico).