Les éléments clés de la génomique de la sécurité alimentaire englobent trois domaines critiques. Ces trois aspects sont exploités avec NeoSeek™ à travers différents partenaires et laboratoires existants.

Technologie de séquençage

Illumina est la plateforme utilisée pour la plupart des applications de NGS utilisées dans les tests NeoSeek. Ces séquenceurs ont permis de réduire considérablement les coûts d’acquisition de données. Cela permet désormais de déployer le service à plus grande échelle et au-delà des laboratoires de recherche utilisés dans les universités et autres organismes de recherche.

Laboratoire et capacités GeneSeek®

Situé à Lincoln, dans le Nebraska, GeneSeek est le plus grand laboratoire de génomique animale au monde. NeoSeek utilise l’infrastructure existante pour traiter les échantillons rapidement et avec des résultats de grande qualité. Ce laboratoire ISO 17025 fournit des résultats génétiques depuis plus d’une décennie.

Bio-informatique

Avec des pipelines construits sur mesure et des bases de données organisées, la bio-informatique est un élément essentiel pour générer des résultats significatifs et de grande qualité. La bio-informatique aide également à structurer les données pour générer des résultats significatifs et exploitables.

Neogen® est le détenteur exclusif de pipelines et d’analyses de l’analyse de métagénome (MGA). Ces services assurent le développement et le déploiement de la bio-informatique pour les tests NeoSeek. La MGA peut compter sur les experts les plus réputés à l’échelle mondiale dans le domaine du microbiome alimentaire et des applications de sécurité alimentaire du séquençage de nouvelle génération.

La bio-informatique est le processus d’assemblage et d’interprétation des données de séquence pour des applications telles que le séquençage du métagénome 16S, le séquençage du génome entier ou la métagénomique du génome entier. Les millions de lectures accompagnant chaque application ont besoin d’une certaine puissance de calcul et de programmes pour assembler les séquences et interpréter les données. La MGA gère des bases de données organisées, des pipelines bio-informatiques exclusifs et des fonctionnalités de création de rapports pour l’utilisateur afin de fournir de possibles informations clés avec le séquençage de nouvelle génération.