Metagenómica del 16S - Tecnología

Usando el ADN utilizado para construir la subunidad 16S, somos capaces de identificar el género y la especie en una muestra. Utilizamos un enfoque metagenómico de la región V4 del 16S. Esto proporciona una identificación de género y/o especie para cada organismo. El enfoque metagenómico permite a las empresas enviar muestras sin enriquecer, productos terminados o varias materias primas.

  • Aprovechando una base de datos de 16S propietaria, somos capaces de identificar el género de cada bacteria presente en una muestra.
  • Identificar posibles candidatos para el organismo de interés a través de unidades taxonómicas operacionales (UTOs).
  • Mostrar la abundancia relativa del género de bacterias presentes en cada muestra.

Metagenómica del 16S

El uso del 16S para aplicaciones del microbioma permite una resolución increíble en aplicaciones de descomposición de alimentos o de microbioma en placa. El análisis metagenómico del 16S permite algunas mejoras fundamentales sobre los métodos tradicionales de subtipificación.

16S vs. Métodos tradicionales

  • Los métodos tradicionales tienen dos problemas específicos: el volumen de trabajo y los sesgos de los medios.
  • El volumen de trabajo a través de la subtipificación de una muestra puede ser enorme. Cada organismo diferente necesita ser aislado para luego utilizar una identificación bioquímica tradicional. En una muestra ambiental de una producción de alimentos, ¡esto podría significar 15-20 asilamientos!
  • El otro elemento es viable pero no cultivable. Los métodos de subtipificación tradicionales introducen un sesgo al solo seleccionar organismos que pueden crecer en los medios utilizados para el aislamiento. El método 16S evita este problema al obtener, amplificar e identificar la secuencia del 16S en una muestra limpia (sin aislamiento).

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